羊村超级防御系统剪彩仪式上，天相骤变，明媚的阳光瞬间被雷电所吞噬，而这一切都是灰太狼最新研发的“天气魔方”所惹的祸！
　　风卷残云、雷鸣电闪，新一轮危机步步逼近，一个庞然大物破土而出，它就是传说中可以带领草原居民逃离家园的诺亚神舟！但是，要想启动神舟就必须先找到失踪千年的蛇族……
　　此时在焕然一新的奢华狼堡内，已贵为青青草原新一代“比尔盖茨”的灰太狼仍在孜孜不倦地升级“天气魔方”，渐渐不受控的风、雨、雷、电在狼堡内肆意狂吼。而整天只能面对着机械版灰太狼的红太狼饱受婚姻危机的困扰，一气之下带着小灰灰离家出走，这个曾经令人艳羡的甜蜜家庭难道就这样走到了尽头？
　　另一边，喜羊羊带着村长研制的机械版喜羊羊一同前去寻找解决气象混乱的方法，却无意间误入天气巢穴。面对语言不通的风、雨、雷、电，平日里能说会道的喜羊羊顿时乱了阵脚，这番牛头不对马嘴的谈判充满了未知和险阻……
　　诺亚神舟能否顺利启动？灰太狼一家还能否回到过去的其乐融融？青青草原是否会从此变为一座死城？